- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- TENxIO
TENxIO
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.TENxIO
导入文件10倍基因组学方法
Bioconductor版本:版本(3.17)
提供了一个结构化的S4方法来导入数据文件从10倍管道。它主要支持单细胞Multiome ATAC +基因表达数据在其他数据类型。主要Bioconductor SingleCellExperiment和RaggedExperiment使用数据表示。
作者:马塞尔•拉莫斯(aut (cre)
维护人员:马塞尔·拉莫斯<烫发。拉莫斯在roswellpark.org >
从内部引用(R,回车引用(“TENxIO”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TENxIO”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“TENxIO”)
| HTML | R脚本 | TENxIO快速入门指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataImport,基础设施,SingleCell,软件 |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.16 (r - 4.2)(0.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 4.2.0),SingleCellExperiment,SummarizedExperiment |
| 进口 | BiocBaseUtils,BiocGenerics,BiocIO,GenomeInfoDb,GenomicRanges矩阵,MatrixGenerics、方法、RCurl readr R.utils,S4Vectors,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,DropletTestFiles,ExperimentHub,HDF5Arrayknitr,RaggedExperiment,rhdf5rmarkdown,Rsamtools,tinytest |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/waldronlab/TENxIO |
| BugReports | https://github.com/waldronlab/TENxIO/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | TENxIO_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | TENxIO_1.2.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | TENxIO_1.2.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | TENxIO_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TENxIO |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TENxIO |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/TENxIO/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TENxIO/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
