Bioconductor版本:版本(3.16)
基因组序列之间共享秩序提供了大量的信息。同线性对象由R包解密提供定量信息,共享秩序。从同线性对象SynExtend提供工具来提取信息。
作者:尼古拉斯·厄尔(aut (cre),艾丹Lakshman aut,施Adelle费尔南多(施),埃里克·赖特(aut)
维修工:尼古拉斯·厄尔在pitt.edu < npc19 >
从内部引用(R,回车引用(“SynExtend”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SynExtend”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SynExtend”)
R脚本 | UsingSynExtend | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,ComparativeGenomics,DataImport,遗传学,软件 |
版本 | 1.9.19 |
Bioconductor自 | BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 4.2.0),解读(> = 2.24.0) |
进口 | 方法,Biostrings,S4Vectors,IRanges跑龙套,统计、并行、图形grDevices |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,igraph,减价,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | SynExtend_1.9.19.tar.gz |
Windows二进制 | SynExtend_1.10.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | SynExtend_1.10.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | SynExtend_1.9.17.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SynExtend |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SynExtend |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SynExtend/ |
包下载报告 | 下载数据 |