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Summix
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DOI:10.18129 / B9.bioc.Summix
Summix:在遗传汇总数据中估计和调整群体结构的方法
Bioconductor版本:发行版(3.16)
此包包含Summix方法，用于估计和调整遗传摘要等位基因频率数据中的祖先。函数summix使用混合模型估计参考祖先比例。adjAF函数为观察到的样本产生祖先调整的等位基因频率，其祖先比例与目标人或样本匹配。
作者:Audrey Hendricks [cre]， Stoneman Haley [aut]
维护者:Audrey Hendricks < Audrey。亨德里克斯，ucdenver。edu>
引文(从R内，输入引用(“Summix”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“Summix”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | Summix.html |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 遗传学，软件，StatisticalMethod，WholeGenome |
| 版本 | 测试盒框 |
| 在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 4.1) |
| 进口 | nloptr、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | rmarkdown，减价，knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/Bioconductor/Summix/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | Summix_2.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Summix_2.4.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | Summix_2.4.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | Summix_2.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Summix |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Summix |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/Summix/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Summix/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
