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SeqVarTools
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SeqVarTools
用于不同数据的工具
Bioconductor版本:发行版(3.16)
SeqArray提供了VCF数据快速访问存储格式的接口，以及用于常见操作和分析的工具。
作者:Stephanie M. Gogarten，郑秀文，Adrienne Stilp
维护者:Stephanie M. Gogarten
引用(从R中，输入引用(“SeqVarTools”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SeqVarTools")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“SeqVarTools”)
| R脚本 | SeqVarTools简介 | |
| R脚本 | SeqVarTools中的迭代器 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneticVariability，遗传学，单核苷酸多态性，测序，软件 |
| 版本 | 1.36.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 2.13 (R-3.0)(9年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | SeqArray |
| 进口 | grDevices，图形，统计，方法，Biobase，BiocGenerics，gdsfmt，GenomicRanges，IRanges，S4Vectors，GWASExactHW，logistf，矩阵，data.table |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，RUnit，stringr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/smgogarten/SeqVarTools |
| 全靠我 | |
| 进口我 | 《创世纪》，VariantExperiment |
| 建议我 | |
| 给我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | SeqVarTools_1.36.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SeqVarTools_1.36.0.zip(64位) |
| macOS二进制文件(x86_64) | SeqVarTools_1.36.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | SeqVarTools_1.36.0.tgz |
| 源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/SeqVarTools |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SeqVarTools |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SeqVarTools/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
