Sconify

DOI:10.18129 / B9.bioc.Sconify

工具箱用于执行KNN-based质量流和血细胞计数数据的统计信息

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包,再基于统计数据和可视化和大规模cytometery数据流。这给tSNE地图“褶皱变化”功能和数据质量度量提供了一个通过评估歧管重叠fcs文件将是相同的。其他应用程序使用这个包包括归责、冗余、标志和测试的相对信息损失低维嵌入相比原来的歧管。

作者:泰勒J烧伤

维修工:泰勒J烧伤<烧伤。泰勒在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Sconify”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“Sconify”)

HTML	R脚本	数据质量
HTML	R脚本	最后的后处理步骤烤饼
HTML	R脚本	找到理想的K
HTML	R脚本	一般烤饼分析
HTML	R脚本	如何处理FCS在R文件为下游使用吗
PDF		参考手册

细节

biocViews	FlowCytometry,ImmunoOncology,MultipleComparison,SingleCell,软件,可视化
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5)
进口	宠物猫、dplyr模糊神经网络,flowCore,ggplot2 Rtsne magrittr跑龙套,统计,readr
链接
建议	knitr、rmarkdown testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Sconify_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	Sconify_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64)	Sconify_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64)	Sconify_1.19.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Sconify
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Sconify
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Sconify/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Sconify/
包下载报告	下载数据