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SWATH2stats
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SWATH2stats
转换和过滤统计包的SWATH数据
Bioconductor版本:发行版(3.16)
此包旨在将来自OpenSWATH软件的SWATH数据转换为其他统计包可读的格式，同时执行过滤、注释和FDR估计。
作者:Peter Blattmann [aut, cre] Moritz Heusel [aut] Ruedi Aebersold [aut]
维护者:Peter Blattmann < Blattmann at imsb.bio .ethz.ch>
引文(从R内，输入引用(“SWATH2stats”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“SWATH2stats”)
| R脚本 | SWATH2stats示例脚本 | |
| R脚本 | SWATH2stats包Vignette | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释，ExperimentalDesign，ImmunoOncology，MassSpectrometry，预处理，蛋白质组学，软件 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(7.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 2.10.0) |
| 进口 | data.table，reshape2，ggplot2，统计，grDevices，图形，utils，biomaRt、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | MSstats，PECA，aLFQ |
| URL | https://peterblattmann.github.io/SWATH2stats/ |
| BugReports | https://github.com/peterblattmann/SWATH2stats |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | SWATH2stats_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SWATH2stats_1.28.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | SWATH2stats_1.28.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | SWATH2stats_1.28.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SWATH2stats |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SWATH2stats |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SWATH2stats/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SWATH2stats/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
