STexampleData

DOI:10.18129 / B9.bioc.STexampleData

收集在转录组数据集在SpatialExperiment Bioconductor格式

Bioconductor版本:版本(3.16)

收集在转录组(SRT)数据集SpatialExperiment Bioconductor格式,用于示例,演示和教程。数据集来自几个不同的SRT平台和来自各种公开的来源。几个数据集包括图像和/或地面实况注释标签。

作者:卢卡斯·m·韦伯(aut (cre)

维护人员:卢卡斯·m·韦伯在gmail.com < lukas.weber.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“STexampleData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“STexampleData”)

HTML	R脚本	STexampleData方案概述
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,Homo_sapiens_Data,Mus_musculus_Data,ReproducibleResearch,SingleCellData,SpatialData
版本	1.6.0
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	ExperimentHub,SpatialExperiment
进口	跑龙套
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,BumpyMatrix
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lmweber/STexampleData
BugReports	https://github.com/lmweber/STexampleData/issues
取决于我
进口我
建议我	ggspavis,nnSVG
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	STexampleData_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/STexampleData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ STexampleData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/STexampleData/
包下载报告	下载数据