SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38

从dbSNP Build 155中提取的人类SNP位点和等位基因，并放置在GRCh38/hg38组件上

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该包中的949,021,448个snp是从位于https://ftp.ncbi.nih.gov/snp/archive/b155/JSON/的1-22号染色体、X、Y和MT的RefSNP JSON文件中提取的(这些文件是由NCBI在2021年5月创建的)。这些snp可以被“注入”到bsgome . hsapiens . ncbi中。GRCh38或BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38。

作者:Herve页面

维护器:Hervé Pagès

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install(" snplocs . hsapens . dbsnp155 . grch38 ")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，遗传学，Homo_sapiens，SNPlocs
版本	0.99.22
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.2.0),BSgenome
进口	方法,跑龙套,BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，BSgenome
链接
建议	Biostrings，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	MungeSumstats
我的链接

包档案

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源包	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38_0.99.22.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38/
包下载报告	下载数据