- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- SEPIRA
SEPIRA
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.SEPIRA
系统表观基因组学推理的监管活动
Bioconductor版本:版本(3.17)
SEPIRA(系统监管活动的表观基因组学推理)是一种算法,推断sample-specific转录因子的活动从全基因组表达或DNA甲基化的样本。
作者:个陈(aut (cre),安德鲁Teschendorff (aut)
维护人员:个陈< cytwarmmay hotmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“SEPIRA”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SEPIRA”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SEPIRA”)
| HTML | R脚本 | 介绍“SEPIRA” |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,GeneRegulation,GeneTarget,网络,NetworkInference,软件,转录 |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.5.0) |
| 进口 | limma(> = 3.32.5)corpcor(> = 1.6.9),并行(> = 3.3.1),统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr、rmarkdown testthat igraph |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SEPIRA_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SEPIRA_1.20.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | SEPIRA_1.20.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | SEPIRA_1.19.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SEPIRA |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SEPIRA |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SEPIRA/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SEPIRA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
