此包适用于Bioconductor 3.16版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本,请参见圣诞老人.
Bioconductor版本:发行版(3.16)
该软件包提供了测量网络和表型之间的关联强度的方法。它通过测量整个网络(Knet)的表型聚类来做到这一点。顶点还可以根据它们与高权重顶点(Knode)的关联强度单独排名。
作者:Alex Cornish [cre, aut]
维护者:Alex Cornish < Alex。康沃尔在icr.ac.uk>
引文(从R内,输入引用(“圣诞老人”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“圣诞老人”)
超文本标记语言 | R脚本 | 圣诞老人简介 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,网络,NetworkEnrichment,软件 |
版本 | 2.34.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(10年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 4.1),igraph |
进口 | 图形,矩阵、方法、统计 |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,生命网络,DLBCL,formatR,knitr,二甲基砜,org.Sc.sgd.db,减价,rmarkdown,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/alexjcornish/SANTA |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | SANTA_2.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | SANTA_2.34.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | SANTA_2.34.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | SANTA_2.34.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SANTA |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SANTA |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SANTA/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SANTA/ |
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