RolDE

DOI:10.18129 / B9.bioc.RolDE

鲁棒纵向微分表达式

Bioconductor版本:发行版(3.16)

RolDE检测噪声高通量数据中两种条件之间的纵向差异表达。甚至适用于有少量缺失值的数据。RolDEis a composite method, consisting of three independent modules with different approaches to detecting longitudinal differential expression. The combination of these diverse modules allows RolDE to robustly detect varying differences in longitudinal trends and expression levels in diverse data types and experimental settings.

作者:Tommi Valikangas [c, t]

维护者:Tommi Valikangas

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

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browseVignettes(“RolDE”)

超文本标记语言	R脚本	简介
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文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，蛋白质组学，回归，软件，StatisticalMethod，TimeCourse
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.2.0)
进口	统计数据、方法腐烂，matrixStats，foreach平行,doParallel，doRNG，rngtools，SummarizedExperiment，nlme，qvalue， grDevices，图形，utils
链接
建议	knitr，printr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/elolab/RolDE
BugReports	https://github.com/elolab/RolDE/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	RolDE_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	RolDE_1.2.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	RolDE_1.2.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	RolDE_1.1.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RolDE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RolDE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RolDE/
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