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RnaSeqSampleSize
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DOI:10.18129 / B9.bioc.RnaSeqSampleSize
此包适用于Bioconductor 3.16版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见RnaSeqSampleSize．
RnaSeqSampleSize
Bioconductor版本:发行版(3.16)
RnaSeqSampleSize包提供了一种基于负二项式模型的样本量计算方法和评估RNA-seq数据差异表达分析的精确测试。它控制FDR进行多次测试，并利用来自真实数据的平均读取计数和分散分布来估计更可靠的样本量。它还具有一些独特的功能，包括感兴趣的基因或途径的估计，功率曲线可视化和参数优化。
作者:赵世林Developer [aut, cre]，李忠义[aut]，郭燕[aut]，盛全虎[aut]，于夏儿[aut]
维护人员:赵世林开发者
引文(从R内，输入引用(“RnaSeqSampleSize”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager")::install("RnaSeqSampleSize")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“RnaSeqSampleSize”)
| R脚本 | RnaSeqSampleSize:根据真实数据估计样本量 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression，ExperimentalDesign，GeneExpression，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件 |
| 版本 | 2.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(7.5年) |
| 许可证 | GPL (>= 2) |
| 取决于 | R (>= 4.0.0)，ggplot2，RnaSeqSampleSizeData |
| 进口 | biomaRt，刨边机，heatmap3，matlab，KEGGREST，方法，grDevices，图形，统计，Rcpp(> = 0.11.2),重新计票，ggpubr，SummarizedExperiment，tidyr，dplyr，tidyselect,跑龙套 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | BiocStyle，knitr，testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | RnaSeqSampleSize_2.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | RnaSeqSampleSize_2.7.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | RnaSeqSampleSize_2.8.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | RnaSeqSampleSize_2.7.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RnaSeqSampleSize |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RnaSeqSampleSize |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RnaSeqSampleSize/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
