ReactomeContentService4R

DOI:10.18129 / B9.bioc.ReactomeContentService4R

Reactome内容服务接口

Bioconductor版本:发行版(3.16)

Reactome是一个免费、开放源代码、开放获取、策划和同行评审的生物分子途径知识库。这个包用于与Reactome内容服务API交互。预先构建的功能将允许用户在Reactome中检索由蛋白质、通路和与特定基因或实体相关的其他分子组成的数据和图像。

作者:潘志林[aut, cre]， Reactome [cph]

维护者:Chi-Lam Poon

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager")::install("ReactomeContentService4R")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ReactomeContentService4R”)

超文本标记语言	R脚本	ReactomeContentService4R
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，通路，Reactome，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	Apache License(>= 2.0) |文件许可证
取决于
进口	httr，jsonlite跑龙套,魔法(> = 2.5.1),data.table，doParallel，foreach、并行
链接
建议	pdftools，testthat，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/reactome/ReactomeContentService4R
BugReports	https://github.com/reactome/ReactomeContentService4R/issues
全靠我
进口我	ReactomeGraph4R
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ReactomeContentService4R_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	ReactomeContentService4R_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ReactomeContentService4R_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ReactomeContentService4R_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ReactomeContentService4R
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ReactomeContentService4R
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ReactomeContentService4R/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ReactomeContentService4R/
软件包下载报告	下载数据