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RcwlPipelines
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DOI:10.18129 / B9.bioc.RcwlPipelines
基于Rcwl的生物信息学管道
Bioconductor版本:发行版(3.16)
基于R和公共工作流语言的生物信息学工具和管道的集合。
作者:胡强[aut, cre]，刘谦[aut]，高爽[aut]
维护者:强虎<强。在roswellpark.org>
引文(从R内，输入引用(“RcwlPipelines”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“RcwlPipelines”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | RcwlPipelines |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 对齐，DNASeq，DataImport，ImmunoOncology，预处理，质量控制，RNASeq，软件，WorkflowStep |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 3.6)，Rcwl，BiocFileCache |
| 进口 | rappdirs，方法，utils，git2r，httr，S4Vectors |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle |
| SystemRequirements | nodejs |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | RcwlPipelines_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制文件(x86_64) | RcwlPipelines_1.14.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | RcwlPipelines_1.14.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RcwlPipelines |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RcwlPipelines |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/RcwlPipelines/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RcwlPipelines/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
