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- Bioconductor 3.16
- 软件包
- Rbowtie
Rbowtie
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DOI:10.18129 / B9.bioc.Rbowtie
R领结包装
Bioconductor版本:版本(3.16)
这个包提供了一个R包装流行的领结短读准仪SpliceMap附近,一个新创拼接结发现和定位工具。使用的包是QuasR bioconductor包。我们建议使用而不是直接使用Rbowtie QuasR包。
作者:安妮塔我们,迈克尔·哈恩(Florian Hahne) B持枪证
维护人员:迈克尔Stadler <迈克尔。施在fmi.ch >
从内部引用(R,回车引用(“Rbowtie”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Rbowtie”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“Rbowtie”)
| HTML | R脚本 | 介绍Rbowtie |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 对齐,测序,软件 |
| 版本 | 1.38.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(10年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |文件许可证 |
| 取决于 | |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | testthat平行,BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | GNU使 |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/fmicompbio/Rbowtie |
| BugReports | https://github.com/fmicompbio/Rbowtie/issues |
| 取决于我 | QuasR |
| 进口我 | crisprBowtie,MACPET,multicrispr |
| 建议我 | crisprDesign,eisaR |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | Rbowtie_1.38.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Rbowtie_1.38.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | Rbowtie_1.38.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | Rbowtie_1.38.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rbowtie |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Rbowtie |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/Rbowtie/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Rbowtie/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
