RNAmodR。RiboMethSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAmodR.RiboMethSeq

RiboMethSeq检测2'-O甲基化

Bioconductor版本:发行版(3.16)

RNAmodR。RiboMethSeq implements the detection of 2'-O methylations on RNA from experimental data generated with the RiboMethSeq protocol. The package builds on the core functionality of the RNAmodR package to detect specific patterns of the modifications in high throughput sequencing data.

作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre]，丹尼斯·拉方丹[ctb, nd]

维护者:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上写道

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RNAmodR.RiboMethSeq")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RNAmodR.RiboMethSeq”)

超文本标记语言	R脚本	RNAmodR。RiboMethSeq
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	测序，软件，可视化，WorkflowStep
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)，RNAmodR(> = 1.5.3)更正
进口	方法,S4Vectors，BiocGenerics，IRanges，GenomicRanges，Gviz
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，rtracklayer，RNAmodR。数据
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.RiboMethSeq
BugReports	https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.RiboMethSeq/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	RNAmodR.RiboMethSeq_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	RNAmodR.RiboMethSeq_1.12.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	RNAmodR.RiboMethSeq_1.12.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	RNAmodR.RiboMethSeq_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAmodR.RiboMethSeq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RNAmodR.RiboMethSeq
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/RNAmodR.RiboMethSeq/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAmodR.RiboMethSeq/
软件包下载报告	下载数据