RNAmodR

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAmodR

高通量测序数据中检测转录后修饰

Bioconductor版本:版本(3.16)

RNAmodR提供类和工作流加载/聚合数据从高througput测序旨在通过分析检测转录后修改的具体模式。此外,公用事业提供验证和可视化结果。RNAmodR包提供了一个核心功能,具体分析策略可以很容易地实现为一个独立的包。

作者:Felix通用恩斯特(aut (cre),丹尼斯·l·j·拉方丹则施,曾经

维修工:Felix通用恩斯特< felix.gm。恩斯特在outlook.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RNAmodR”)

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文档

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HTML	R脚本	RNAmodR
HTML	R脚本	RNAmodR——创建一个新的检测策略的新类
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细节

biocViews	基础设施,测序,软件,可视化,WorkflowStep
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0),S4Vectors(> = 0.27.12),IRanges(> = 2.23.9),GenomicRanges,Modstrings
进口	方法、统计grDevices,matrixStats,BiocGenerics,Biostrings(> = 2.57.2),BiocParallel,GenomicFeatures,GenomicAlignments,GenomeInfoDb,rtracklayer,Rsamtools,BSgenome,RColorBrewer,colorRamps,ggplot2,Gviz(> = 1.31.0),reshape2、图形、ROCR
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,RNAmodR.Data
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/FelixErnst/RNAmodR
BugReports	https://github.com/FelixErnst/RNAmodR/issues
取决于我	RNAmodR.AlkAnilineSeq,RNAmodR.ML,RNAmodR.RiboMethSeq
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RNAmodR_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	RNAmodR_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64)	RNAmodR_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64)	RNAmodR_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAmodR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAmodR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/RNAmodR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAmodR/
包下载报告	下载数据