QFeatures

DOI:10.18129 / B9.bioc.QFeatures

质谱数据的定量特征

Bioconductor版本:发行版(3.16)

QFeatures基础设施能够管理和处理高通量质谱分析的定量特征。它提供了熟悉的Bioconductor用户体验，以连贯和易于处理的格式管理不同检测水平(如肽谱匹配，肽和蛋白质)的定量数据。

作者:Laurent Gatto [aut, cre]——克里斯托夫·凡达

维护者:Laurent Gatto < Laurent。Gatto at uclouvain.be>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“QFeatures”)

超文本标记语言	R脚本	来自QFeatures对象的数据可视化
超文本标记语言	R脚本	用QFeatures处理定量蛋白质组学数据
超文本标记语言	R脚本	质谱数据的定量特征
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，MassSpectrometry，代谢组学，蛋白质组学，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)，MultiAssayExperiment
进口	方法，统计，效用，S4Vectors，IRanges，SummarizedExperiment，BiocGenerics，ProtGenerics(> = 1.27.1),AnnotationFilter，lazyeval，Biobase，MsCoreUtils(> = 1.7.2),igraph，情节
链接
建议	SingleCellExperiment，矩阵，HDF5Array，msdata，ggplot2，gplots，dplyr，limma，magrittr，DT，闪亮的，shinydashboard，testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown，vsn，preprocessCore，matrixStats，imputeLCMD，pcaMethods，嫁祸于，规范，ComplexHeatmap
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/QFeatures
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/QFeatures/issues
全靠我	msqrob2，scp，scpdata
进口我	MetaboAnnotation，MsExperiment，PSMatch
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	QFeatures_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	QFeatures_1.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	QFeatures_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	QFeatures_1.7.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/QFeatures
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/QFeatures
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/QFeatures/
软件包下载报告	下载数据