QFeatures

DOI:10.18129 / B9.bioc.QFeatures

质谱数据的定量特征

Bioconductor版本:发行版(3.16)

QFeatures基础设施能够管理和处理高通量质谱分析的定量特征。它提供了熟悉的Bioconductor用户体验,以连贯和易于处理的格式管理不同检测水平(如肽谱匹配,肽和蛋白质)的定量数据。

作者:Laurent Gatto [aut, cre]——克里斯托夫·凡达

维护者:Laurent Gatto < Laurent。Gatto at uclouvain.be>

引文(从R内,输入引用(“QFeatures”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“QFeatures”)

超文本标记语言 R脚本 来自QFeatures对象的数据可视化
超文本标记语言 R脚本 用QFeatures处理定量蛋白质组学数据
超文本标记语言 R脚本 质谱数据的定量特征
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 基础设施MassSpectrometry代谢组学蛋白质组学软件
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.0),MultiAssayExperiment
进口 方法,统计,效用,S4VectorsIRangesSummarizedExperimentBiocGenericsProtGenerics(> = 1.27.1),AnnotationFilterlazyevalBiobaseMsCoreUtils(> = 1.7.2),igraph情节
链接
建议 SingleCellExperiment矩阵HDF5Arraymsdataggplot2gplotsdplyrlimmamagrittrDT闪亮的shinydashboardtestthatknitrBiocStylermarkdownvsnpreprocessCorematrixStatsimputeLCMDpcaMethods嫁祸于规范ComplexHeatmap
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/RforMassSpectrometry/QFeatures
BugReports https://github.com/RforMassSpectrometry/QFeatures/issues
全靠我 msqrob2scpscpdata
进口我 MetaboAnnotationMsExperimentPSMatch
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 QFeatures_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 QFeatures_1.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) QFeatures_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) QFeatures_1.7.3.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/QFeatures
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/QFeatures
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/QFeatures/
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