Bioconductor版本:版本(3.17)
注释HPLC-ESI-MS脂质数据在积极的电离模式从一个实验,让文化海洋硅藻Phaeodactylum tricornutum治疗与不同浓度的过氧化氢(H2O2)诱导氧化应激。中所描述的实验是格拉夫·范·Creveld et al ., 2015年,“早期在线粒体氧化还原内稳态扰动响应环境压力预测在硅藻细胞命运,“ISME 9:385 - 395》杂志上。PtH2O2lipids包含两个对象:相机xsAnnotate对象(PtH2O2lipids xsAnnotate美元)和LOBSTAHS LOBSet对象(PtH2O2lipids xsAnnotate LOBSet美元)。LOBSet包括从数据库默认LOBSTAHS假定的复合作业。异构体注释记录在其他三个LOBSet插槽中。
作者:期刊格拉夫van Creveld (aut) Shilo Rosenwasser (aut),达妮埃拉·沙茨(aut),宜兰科伦(aut),艾瑟夫巴德瓦迪(aut),詹姆斯·柯林斯(cre)
维修工:詹姆斯·柯林斯< james.r。柯林斯在aya.yale.edu >
从内部引用(R,回车引用(“PtH2O2lipids”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PtH2O2lipids”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | CellCulture,ExperimentData,MassSpectrometryData,Phaeodactylum_tricornutum_data,ReproducibleResearch |
版本 | 1.26.0 |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.3),xcms,相机,LOBSTAHS、方法、跑龙套 |
进口 | |
链接 | |
建议 | gplots RColorBrewer,集群,素食主义者 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2014.136https://github.com/vanmooylipidomics/PtH2O2lipidshttp://www.whoi.edu/page.do?pid=133616&tid=282&cid=192529 |
BugReports | https://github.com/vanmooylipidomics/PtH2O2lipids/issues/new |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | LOBSTAHS |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | PtH2O2lipids_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PtH2O2lipids |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PtH2O2lipids |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PtH2O2lipids/ |
包下载报告 | 下载数据 |