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PhenoGeneRanker
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DOI:10.18129 / B9.bioc.PhenoGeneRanker
PhenoGeneRanker:基因和表型优先级工具
Bioconductor版本:版本(3.16)
这个包是一个基因/表型优先级的工具,利用多元异构基因表型网络。PhenoGeneRanker允许多层基因和表型网络。它还计算经验假定值的基因/表型排名使用随机分层抽样的基因/表型网络中基于他们的连接度。https://dl.acm.org/doi/10.1145/3307339.3342155。
作者:Cagatay Dursun (aut (cre)
维护人员:Cagatay Dursun < cagataydursun gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“PhenoGeneRanker”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PhenoGeneRanker”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“PhenoGeneRanker”)
| HTML | R脚本 | PhenoGeneRanker |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BiomedicalInformatics,GenePrediction,GraphAndNetwork,网络,NetworkInference,通路,软件,SystemsBiology |
| 版本 | 1.6.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年) |
| 许可证 | 创作共用署名4.0国际许可证 |
| 取决于 | |
| 进口 | igraph,矩阵,foreach,doParallel,dplyr,统计,跑龙套,平行 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | PhenoGeneRanker_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | PhenoGeneRanker_1.6.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | PhenoGeneRanker_1.6.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | PhenoGeneRanker_1.6.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PhenoGeneRanker |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PhenoGeneRanker |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/PhenoGeneRanker/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PhenoGeneRanker/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
