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NormalyzerDE
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DOI:10.18129 / B9.bioc.NormalyzerDE
归一化方法的评价及差分表达式分析统计量的计算
Bioconductor版本:发行版(3.16)
NormalyzerDE提供了基于LC-MS的表达式数据的归一化方法筛选。它使用现有的方法和一种新的时间分段方法计算一系列归一化矩阵，计算性能度量并生成一份评估报告。此外，它为基于Limma或ANOVA的差异表达式分析提供了一个简单的工具。
作者:Jakob Willforss
维护者:Jakob Willforss < Jakob。在hotmail.com willforss >
引用(从R中，输入引用(“NormalyzerDE”)):
安装
要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("NormalyzerDE")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“NormalyzerDE”)
| R脚本 | 使用NormalyzerDE的差异表达和反技术偏见 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 贝叶斯，DifferentialExpression，代谢组学，MultipleComparison，归一化，蛋白质组学，软件，可视化 |
| 版本 | 1.16.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.8 (R-3.5)(4年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.6) |
| 进口 | vsn，preprocessCore，limma，质量，猿，车，ggplot2、方法、Biobase，RcmdrMisc，光栅,跑龙套,统计数据,SummarizedExperiment，matrixStats，ggforce |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，testthat，rmarkdown，roxygen2，hexbin，BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/ComputationalProteomics/NormalyzerDE |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | NormalyzerDE_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | NormalyzerDE_1.16.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | NormalyzerDE_1.16.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | NormalyzerDE_1.15.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NormalyzerDE |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NormalyzerDE |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NormalyzerDE/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
