纳米管

DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoTube

一个简单的管道为NanoString nCounter数据分析

Bioconductor版本:版本(3.17)

纳米管包括函数处理、质量控制、分析和可视化的NanoString nCounter数据。分析功能包括微分分析和基因分析方法,以及后处理步骤来帮助理解结果。额外的功能包括支持互操作性与其他Bioconductor NanoString数据分析包。

作者:类(cre, aut]迦勒,Caiden Lukan(施)

维护人员:迦勒类< cclass butler.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“纳米管”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“纳米管”)

HTML	R脚本	纳米管装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,质量控制,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (> = 4.1),Biobaseggplot2,limma
进口	fgsea、方法、重塑统计,跑龙套
链接
建议	网格,kableExtra knitr,NanoStringDiff,情节pheatmap rlang、rmarkdown ruv,RUVSeq闪亮的、testthat xlsx
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	NanoTube_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	NanoTube_1.6.0.zip
macOS二进制(x86_64)	NanoTube_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64)	NanoTube_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoTube
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/纳米管
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/NanoTube/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NanoTube/
包下载报告	下载数据