多亚sayExexperiment

doi:10.18129/b9.bioc.multiassayexyperiment

用于集成生物导体中多词实验的软件

生物导体版本:版本(3.15)

MultiasSayExperiment协调了对一组重叠标本进行的多个实验测定的数据管理。它通过扩展概念,从总结性特征扩展概念,支持标准数据类别的单个测定方法,并允许通过基因组范围或隆隆射击子集进行子集,从而提供了熟悉的生物通用用户体验。提供了将数据重塑为宽和长格式的设施,以适应图形和下游分析。

作者:Marcel Ramos [AUT,CRE],Levi Waldron [AUT],Multiassay Sig [CTB]

维护者:Marcel Ramos

引用(从r内,输入引用(“多亚sayexperiment”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ MultiasSayExperiment”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ MultiasSayExperiment”)

html R脚本 多测实验的协调分析
html R脚本 HDF5Array和MultiasSayExperiment
PDF MultiasSayExperiment_Cheatsheet.pdf
html R脚本 快速入门指南
PDF 参考手册
文本 消息
视频 多亚sayExexperiment演示
视频 马塞尔·拉莫斯(Marcel Ramos),研讨会200:多亚雪人和策展人和策展人生物导体2020车间

细节

生物浏览 datarepresentation,,,,基础设施,,,,软件
版本 1.22.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 4.2.0),总结性特征(> = 1.3.81)
进口 方法,基因组机(> = 1.25.93),生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.23.19),iranges,,,,生物酶,统计花花公子,UTILS
链接
建议 生物使用,,,,HDF5Array(> = 1.19.17),尼特,,,,maftools(> = 2.7.10),rmarkDown,,,,R.RSP,,,,破烂的经历,,,,insctr,,,,生存,,,,幸存者,,,,测试
系统要求
增强
URL http://waldronlab.io/multiassayexperiment/
BugReports https://github.com/waldronlab/multiassayexperiment/issues
取决于我 卡格,,,,cbioportaldata,,,,分类,,,,策展,,,,评估,,,,Glmsparsenet,,,,Hipathia,,,,intad,,,,米娅,,,,微生物膜,,,,Midashla,,,,失误,,,,OMICSPCADATA,,,,qfeatures,,,,Singlecellmultimodal,,,,Terratcgadata,,,,Timirgen
进口我 辅助,,,,amaretto,,,,动物库,,,,自治,,,,生物签名,,,,coregx,,,,畜栏,,,,策展tbdata,,,,埃尔默,,,,Findit2,,,,Gopro,,,,爱马仕,,,,HMP2DATA,,,,linkHD,,,,代谢组工厂,,,,妈妈,,,,Mudata,,,,Multibac,,,,netdx,,,,OMICSPCA,,,,OMICSPRINT,,,,帕德玛,,,,pdatk,,,,Pharmacogx,,,,ropls,,,,SCP,,,,tcgautils,,,,xcore
建议我 Bioconcotk,,,,Brgedata,,,,cnvranger,,,,装饰,,,,maftools,,,,MOFA2,,,,Mofadata,,,,多胎,,,,破烂的经历
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 MultiasSayExperiment_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 MultiasSayExperiment_1.22.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) MultiasSayExperiment_1.22.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multiassayexperiment
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/multiassayexperiment
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/multiassayexperiment/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网