MsBackendRawFileReader

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendRawFileReader

质谱后端阅读热飞世尔科学原始文件

Bioconductor版本:发行版(3.16)

使用Thermo Fisher Scientific的NewRawFileReader . net库实现了光谱包的MsBackend。该包是对rawrr包引入的功能的泛化(科克曼T.等人(2020)) )本包中定义的方法应该扩展Spectra Bioconductor包。

作者:Christian Panse [aut, cre],托比亚斯·科克曼[au]

维护者:Christian Panse

引用(从R中,输入引用(“MsBackendRawFileReader”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MsBackendRawFileReader")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“MsBackendRawFileReader”)

超文本标记语言 R脚本 关于使用和扩展' MsBackendRawFileReader '后端。
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文本 安装

细节

biocViews MassSpectrometry代谢组学蛋白质组学软件
版本 1.4.0
Bioconductor自 BioC 3.14 (R-4.1)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 4.1),方法,光谱(> = 1.5.8)
进口 MsCoreUtilsS4VectorsIRangesrawrr(> = 1.3.6),跑龙套,BiocParallel
链接
建议 BiocStyle(> = 2.5),ExperimentHubMsBackendMgfknitr晶格mzRprotViz(> = 0.7),rmarkdown鞑靼(> = 1.5),testthat
SystemRequirements mono-runtime 4。x或更高(包括System。在Linux/macOS上的。net Framework(>= 4.5.1)在Microsoft Windows上。
增强了
URL https://github.com/fgcz/MsBackendRawFileReader
BugReports https://github.com/fgcz/MsBackendRawFileReader/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 MsBackendRawFileReader_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 MsBackendRawFileReader_1.4.0.zip
macOS二进制(x86_64) MsBackendRawFileReader_1.4.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendRawFileReader
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MsBackendRawFileReader
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendRawFileReader/
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