MsBackendMassbank

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendMassbank

质谱数据后台MassBank记录文件

Bioconductor版本:发行版(3.16)

质谱(MS)数据后台支持导入和导出来自MassBank记录文件的MS/MS谱库。不同的后端可用，允许处理普通MassBank文本文件格式的数据，也允许直接与MassBank SQL数据库交互。来自这个包的对象应该与光谱生物导体包一起使用。因此，这个包将MassBank支持添加到spectrum包中。

作者:rformassometry Package Maintainer [cre]， Michael Witting [aut]，约翰内斯·莱纳[法国]，迈克尔·斯特拉维斯[ctb]

维护者:rformassspectra Package Maintainer < rformassspectrometry.org>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“MsBackendMassbank”)

超文本标记语言	R脚本	MsBackendMassbank的描述和用法
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，基础设施，MassSpectrometry，代谢组学，软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0),光谱(> = 1.5.17)
进口	BiocParallel，S4Vectors，IRanges、方法、ProtGenerics，MsCoreUtils，DBI,跑龙套
链接
建议	testthat，knitr(> = 1.1.0版),roxygen2，BiocStyle(> = 2.5.19),RSQLite，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMassbank
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMassbank/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MsBackendMassbank_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	MsBackendMassbank_1.6.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	MsBackendMassbank_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MsBackendMassbank_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMassbank
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MsBackendMassbank
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendMassbank/
包下载报告	下载数据