MetaNeighbor

DOI:10.18129 / B9.bioc.MetaNeighbor

单细胞复现性分析

Bioconductor版本:版本(3.17)

MetaNeighbor允许用户跨数据集使用的邻居投票量化细胞类型可复制性。

作者:梅根乌鸦(aut (cre),萨拉Ballouz[所有],Manthan沙(施),斯蒂芬菲舍尔(施),杰西·吉利斯(aut)

维修工:斯蒂芬费舍尔菲舍尔< cshl.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MetaNeighbor”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF	R脚本	MetaNeighbor用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	去,GeneExpression,ImmunoOncology,MultipleComparison,SingleCell,软件,转录组
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.5)
进口	grDevices、图形的方法,统计数据(> = 3.4),跑龙套(> = 3.4),矩阵(> = 1.2),matrixStats (> = 0.54), beanplot (> = 1.2), gplots (> = 3.0.1) RColorBrewer (> = 1.1.2),SummarizedExperiment(> = 1.12),SingleCellExperiment宠物猫,dplyr igraph tidyr, ggplot2
链接
建议	knitr (> = 1.17), rmarkdown (> = 1.6), testthat (> = 1.0.2) UpSetR
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MetaNeighbor_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	MetaNeighbor_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MetaNeighbor_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MetaNeighbor_1.19.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MetaNeighbor
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MetaNeighbor
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MetaNeighbor/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MetaNeighbor/
包下载报告	下载数据