MSstatsConvert

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstatsConvert

从各种质谱信号处理工具导入数据到MSstats格式

Bioconductor版本:发行版(3.16)

MSstatsConvert提供了将质谱数据处理工具的报告导入适合使用MSstats和MSstatsTMT包进行统计分析的R格式的工具。

作者:Mateusz Staniak [aut, cre], Meena Choi [aut], Ting Huang [aut], Olga Vitek [aut]

维护者:Mateusz Staniak < mst at mstaniak.pl>

引文(从R内,输入引用(“MSstatsConvert”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MSstatsConvert”)

超文本标记语言 R脚本 使用MSstatsConvert
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportMassSpectrometry蛋白质组学质量控制软件
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.0)
进口 data.tablelog4r、方法、使彻底失败跑龙套,stringi
链接
建议 tinytestcovrknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 MSstatsMSstatsLiPMSstatsPTMMSstatsShinyMSstatsTMT
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 MSstatsConvert_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 MSstatsConvert_1.8.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) MSstatsConvert_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) MSstatsConvert_1.7.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsConvert
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MSstatsConvert
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MSstatsConvert/
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