MSstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstats

蛋白质意义分析的DDA、SRM和DIA Label-free或基于标签的蛋白质组学实验

Bioconductor版本:版本(3.16)

一组工具,您相对蛋白质意义的统计分析,SRM和DIA实验。

作者:之一Meena崔(aut (cre) Mateusz Staniak (aut) Tsung-Heng蔡(aut) Ting黄(aut),奥尔加Vitek (aut)

维护人员:之一Meena崔< mnchoi67 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MSstats”)

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文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MSstats”)

HTML	R脚本	MSstats:蛋白质/肽意义分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	ImmunoOncology,MassSpectrometry,归一化,蛋白质组学,质量控制,软件,TimeCourse
版本	4.6.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(9年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0)
进口	MSstatsConvert,data.table,使彻底失败,质量,limma,lme4,preprocessCore,生存跑龙套,Rcpp,ggplot2,ggrepel,gplots,marray统计,grDevices、图形的方法
链接	Rcpp,RcppArmadillo
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,tinytest,covr,减价
SystemRequirements
增强了
URL	http://msstats.org
BugReports	https://groups.google.com/forum/ # ! / msstats论坛
取决于我
进口我	artMS,MSstatsLiP,MSstatsPTM,MSstatsSampleSize,MSstatsShiny,MSstatsTMT
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MSstats_4.6.0.tar.gz
Windows二进制	MSstats_4.6.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MSstats_4.6.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MSstats_4.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstats
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MSstats
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MSstats/
包下载报告	下载数据