MSPrep

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSPrep

概括，过滤，输入和标准化代谢组学数据包

Bioconductor版本:发行版(3.16)

Package执行复制的摘要、按频率进行过滤、用于输入缺失数据的几种不同选项，以及用于转换、批量更正和规范化数据的各种选项。

作者:Max McGrath [aut, cre]， Matt Mulvahill [aut]， Grant Hughes [aut]， Sean Jacobson [aut]， Harrison Pielke-lombardo [aut]， Katerina kchris [aut, cph, ths]

维护者:Max McGrath < Max。McGrath在ucdenver。edu>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MSPrep”)

超文本标记语言	R脚本	使用MSPrep
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	MassSpectrometry，代谢组学，预处理，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.1.0)
进口	SummarizedExperiment，S4Vectors，pcaMethods(> = 1.24.0),crmn，preprocessCore，dplyr(> = 0.7),tidyr，宠物猫(> = 1.2),magrittr，rlang统计数据,stringr、方法、missForest，股东价值分析，VIM
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat(> = 1.0.2中)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/KechrisLab/MSPrep
BugReports	https://github.com/KechrisLab/MSPrep/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MSPrep_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	MSPrep_1.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	MSPrep_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MSPrep_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSPrep
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MSPrep
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MSPrep/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MSPrep/
软件包下载报告	下载数据