MPRAnalyze

DOI:10.18129 / B9.bioc.MPRAnalyze

MPRA数据的统计分析

Bioconductor版本:版本(3.17)

MPRAnalyze为数据分析提供统计框架生成的大规模并行记者化验(MPRAs),用来直接测量增强活动。MPRAnalyze可用于增强活动的量化,分类之间的活性增强剂和增强剂的比较分析活动的条件。嵌套MPRAnalyze构建一个对广义线性模型(glm)与DNA和RNA的观察,很容易可调各种实验设计和条件,提供了一组严格的统计testig方案。

作者:Tal Ashuach (aut (cre),大卫·费舍尔(aut),阿娜特Kriemer[所有],费边书J[所有],Nir Yosef(施)

维护人员:Tal Ashuach < tal_ashuach berkeley.edu >

从内部引用(R,回车引用(“MPRAnalyze”)):

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MPRAnalyze”)

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细节

biocViews CellBasedAssays,CellBiology,分类,DifferentialExpression,ExperimentalDesign,GeneExpression,ImmunoOncology,测序,软件,StatisticalMethod
版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 BiocParallel、方法、进度数据,SummarizedExperiment
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URL https://github.com/YosefLab/MPRAnalyze
BugReports https://github.com/YosefLab/MPRAnalyze
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 MPRAnalyze_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 MPRAnalyze_1.18.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) MPRAnalyze_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64) MPRAnalyze_1.17.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MPRAnalyze
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MPRAnalyze
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MPRAnalyze/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MPRAnalyze/
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