中长期规划

DOI:10.18129 / B9.bioc.MLP

平均对数P分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

途径分析基于p值相关的基因从感兴趣的基因表达分析。实用函数能够从基因本体论生物过程(GOBP)、分子函数(GOMF)和细胞成分(GOCC)、京都基因组基因百科全书(KEGG)和反应组数据库中提取途径。方法和辅助功能，显示结果为表格，路径显著性barplot，基因本体图和路径显著性。

作者:Nandini Raghavan [aut]， Tobias Verbeke [aut]， An De Bondt [aut]， Javier Cabrera [ctb]， Dhammika Amaratunga [ctb]， Tine Casneuf [ctb]， Willem Ligtenberg [ctb]， Laure Cougnaud [cre]， Katarzyna Gorczak [ctb]

维护者:Tobias Verbeke < Tobias。Verbeke在openanalysis .eu>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“延时”)

PDF	R脚本	UsingMLP
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	去，GeneExpression，遗传学，KEGG，通路，Reactome，软件
版本	1.46.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(11.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	AnnotationDbi，gplots，图形，统计，效用
链接
建议	GO.db，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，org.Rn.eg.db，org.Cf.eg.db，org.Mmu.eg.db，KEGGREST，注释，Rgraphviz，GOstats，图，limma，mouse4302.db，reactome.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	esetVis
建议我	a4
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MLP_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	MLP_1.46.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	MLP_1.46.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MLP_1.45.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MLP
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MLP
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MLP/
软件包下载报告	下载数据