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MACSr
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DOI:10.18129 / B9.bioc.MACSr
MACS:基于模型的ChIP-Seq分析
Bioconductor版本:发行版(3.16)
基于模型的ChIP-Seq分析(MACS)是一种广泛用于识别转录因子结合位点的工具。这个包是最新MACS3的R包装器。
作者:胡强[aut, cre]
维护者:强胡<强。在roswellpark.org>
引文(从R内，输入引用(“MACSr”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“MACSr”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | MACSr |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | ATACSeq，ChIPSeq，ImmunoOncology，软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
| 许可证 | BSD_3_clause +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 4.1.0) |
| 进口 | 跑龙套,网状，S4Vectors、方法、蛇怪，ExperimentHub，AnnotationHub |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，MACSdata |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | MACSr_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制文件(x86_64) | MACSr_1.6.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | MACSr_1.6.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MACSr |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MACSr |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/MACSr/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MACSr/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
