Bioconductor版本:发行版(3.16)
LoomExperiment包提供了一种方法,可以轻松地将Bioconductor“实验”类转换为织机文件,反之亦然。
作者:马丁·摩根,丹尼尔·范·特维斯克
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“LoomExperiment”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“LoomExperiment”)
超文本标记语言 | R脚本 | LoomExperiment类的介绍 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,DataRepresentation,ImmunoOncology,基础设施,SingleCell,软件 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(4年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.5.0),S4Vectors,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment、方法、rhdf5,BiocIO |
进口 | DelayedArray,GenomicRanges,HDF5Array,矩阵统计数据,stringr,跑龙套 |
链接 | |
建议 | testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown,网状 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | OSCA.intro |
进口我 | |
建议我 | 杂环胺 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | LoomExperiment_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | LoomExperiment_1.16.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | LoomExperiment_1.16.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | LoomExperiment_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LoomExperiment |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/LoomExperiment |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/LoomExperiment/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/LoomExperiment/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |