LoomExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.LoomExperiment

LoomExperiment容器

Bioconductor版本:发行版(3.16)

LoomExperiment包提供了一种方法,可以轻松地将Bioconductor“实验”类转换为织机文件,反之亦然。

作者:马丁·摩根,丹尼尔·范·特维斯克

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“LoomExperiment”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“LoomExperiment”)

超文本标记语言 R脚本 LoomExperiment类的介绍
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportDataRepresentationImmunoOncology基础设施SingleCell软件
版本 1.16.0
在Bioconductor BioC 3.8 (R-3.5)(4年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.5.0),S4VectorsSingleCellExperimentSummarizedExperiment、方法、rhdf5BiocIO
进口 DelayedArrayGenomicRangesHDF5Array矩阵统计数据,stringr,跑龙套
链接
建议 testthatBiocStyleknitrrmarkdown网状
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 OSCA.intro
进口我
建议我 杂环胺
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 LoomExperiment_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 LoomExperiment_1.16.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) LoomExperiment_1.16.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) LoomExperiment_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LoomExperiment
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/LoomExperiment
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/LoomExperiment/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/LoomExperiment/
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Bioconductor

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网