KEGGREST

DOI:10.18129 / B9.bioc.KEGGREST

京都基因和基因组百科全书(KEGG)的客户端REST访问

Bioconductor版本:发行版(3.16)

为京都基因和基因组百科全书(KEGG) REST服务器提供客户端接口的包。基于J. Zhang, R. Gentleman和Marc Carlson的KEGGSOAP,以及Aurelien Mazurie的KEGG (python包)。

作者:Dan Tenenbaum [aut], Jeremy Volkening [ctb], Bioconductor Package Maintainer [aut, cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“KEGGREST”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“KEGGREST”)

超文本标记语言 R脚本 访问KEGG REST API
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释KEGG通路软件ThirdPartyClient
版本 1.38.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(9.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.5.0)
进口 方法,httrpngBiostrings
链接
建议 RUnitBiocGenericsknitr减价
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 Hiiragi2013ROntoTools
进口我 亚当adSplitAnnotationDbi吸引BiocSetChIPpeakAnnocnEnrichmentBrowserfamat小伙子KEGGlincsMetaboSignalMWASToolsNoRCEPADOGpairkatpathviewRnaSeqSampleSizeSBGNview击杀transomics2cytoscapeYAPSA
建议我 类别categoryCompareGenomicRangesglobaltestiSEEu中长期规划莲花rGREATRTopper
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 KEGGREST_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 KEGGREST_1.38.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) KEGGREST_1.38.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) KEGGREST_1.38.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGREST
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/KEGGREST
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGREST/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网