IsoCorrectoR

DOI:10.18129 / B9.bioc.IsoCorrectoR

天然同位素丰度校正和示踪剂纯度MS和MS / MS数据稳定同位素标记实验

Bioconductor版本:版本(3.17)

IsoCorrectoR执行从稳定同位素质谱数据的校正标签/跟踪代谢组学实验对天然示踪同位素丰度和杂质。MS和MS / MS数据可以纠正(与任何示踪同位素:13 c、15 n, 18 o…),以及超高分辨率女士multiple-tracer实验数据(例如13 c和15 n同时使用)。看到Bioconductor包IsoCorrectoRGUI IsoCorrectoR图形用户界面。注意:R版本4.0.0,校正结果写入Excel文件可能目前无法在Windows上工作。然而,写作结果csv作品。

作者:基督教科勒(cre, aut),保罗·海因里希(aut)

维护人员:基督教科勒<基督教。科勒在ur.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“IsoCorrectoR”)

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文档

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HTML	R脚本	IsoCorrectoR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology,MassSpectrometry,代谢组学,预处理,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5)
进口	dplyr magrittr,方法、quadprog readr, readxl, stringr,宠物猫,工具,跑龙套,pracma WriteXLS
链接
建议	IsoCorrectoRGUI,rmarkdown knitr testthat,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://genomics.ur.de/files/IsoCorrectoR/
取决于我
进口我	IsoCorrectoRGUI
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	IsoCorrectoR_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	IsoCorrectoR_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64)	IsoCorrectoR_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)	IsoCorrectoR_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IsoCorrectoR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ IsoCorrectoR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/IsoCorrectoR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IsoCorrectoR/
包下载报告	下载数据