InteractiveComplexHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.InteractiveComplexHeatmap

制作交互式复杂热图

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这个包可以很容易地将由ComplexHeatmap包生成的热图制作成交互式应用程序。它提供了两种类型的交互:2.在交互图形设备上。它还提供了集成交互式热图小部件的功能，用于更复杂的Shiny应用程序开发。

作者:顾祖光[aut, cre]

维护者:祖光谷

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“InteractiveComplexHeatmap”)

超文本标记语言	R脚本	1.如何交互式地可视化热图
超文本标记语言	R脚本	2.交互式复杂热图是如何实现的
超文本标记语言	R脚本	3.用于Shiny应用程序开发的函数
超文本标记语言	R脚本	4.热图上的装饰
超文本标记语言	R脚本	5.交互由pheatmap()、heatmap 2()和heatmap()间接生成的热图
超文本标记语言	R脚本	6.一个闪亮的应用程序可视化的DESeq2结果
超文本标记语言	R脚本	7.从头开始实现交互式热图
超文本标记语言	R脚本	8.与合作者分享互动式热图
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	测序，软件，可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.0.0)，ComplexHeatmap(> = 2.11.0)
进口	grDevices,统计数据,闪亮的、网格GetoptLong，S4Vectors(> = 0.26.1),消化，IRanges，kableExtra(>= 1.3.1)， utils，svglite，htmltools，clisymbols，jsonlite，RColorBrewer，fontawesome
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat，EnrichedHeatmap，GenomicRanges，data.table，circlize，GenomicFeatures，tidyverse，tidyHeatmap，集群，org.Hs.eg.db，simplifyEnrichment，GO.db，SC3，GOexpress，SingleCellExperiment，嘘，gplots，pheatmap，气道，DESeq2，DT，可乐，BiocManager，gridtext，HilbertCurve(> = 1.21.1),shinydashboard，SummarizedExperiment，pkgndep，ks
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/InteractiveComplexHeatmap
BugReports	https://github.com/jokergoo/InteractiveComplexHeatmap/issues
全靠我
进口我
建议我	simplifyEnrichment
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	InteractiveComplexHeatmap_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	InteractiveComplexHeatmap_1.6.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	InteractiveComplexHeatmap_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	InteractiveComplexHeatmap_1.5.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/InteractiveComplexHeatmap
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/InteractiveComplexHeatmap
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/InteractiveComplexHeatmap/
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