HPAanalyze

DOI:10.18129 / B9.bioc.HPAanalyze

检索和分析人类蛋白质图谱的数据

Bioconductor版本:发行版(3.16)

提供检索、探索性分析和可视化人类蛋白质图谱数据的功能。

作者:Anh Nhat Tran [aut, cre]

维护人员:Anh Nhat Tran

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HPAanalyze”)

超文本标记语言	R脚本	1.快速入门指南:使用HPAanalyze在一个函数中获取和可视化人类蛋白质图谱(HPA)数据
超文本标记语言	R脚本	2.深入:使用HPAanalyze在R中处理人类蛋白质图谱(HPA)数据
超文本标记语言	R脚本	3.教程:结合HPAanalyze与您的人类蛋白质图谱(HPA)查询
超文本标记语言	R脚本	4.教程:脱机使用人类蛋白质图谱(HPA) xml文件
超文本标记语言	R脚本	5.教程:导出人类蛋白质图谱(HPA)数据为JSON
超文本标记语言	R脚本	6.教程:从人类蛋白质图谱下载组织学图像
超文本标记语言	R脚本	99.代码的数字从HPAanalyze论文
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBiology，蛋白质组学，软件，可视化
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(4年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	dplyr，openxlsx，ggplot2，宠物猫，xml2，统计，utils，gridExtra
链接
建议	knitr，rmarkdown，减价，devtools，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/anhtr/HPAanalyze
BugReports	https://github.com/anhtr/HPAanalyze/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	HPAanalyze_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	HPAanalyze_1.16.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	HPAanalyze_1.16.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	HPAanalyze_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HPAanalyze
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HPAanalyze
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/HPAanalyze/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HPAanalyze/
软件包下载报告	下载数据