HPAStainR

DOI:10.18129 / B9.bioc.HPAStainR

查询多种蛋白质和基因的人类蛋白质图谱染色数据

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这个包是围绕HPAStainR函数构建的。HPAStainR函数的目的是查询Human Protein Atlas中的可视化染色数据,返回染色排序的细胞类型表。该函数还有多个参数可个性化输出,包括癌症数据、csv可读名称、修改结果的置信级别等。其他函数专门用于轻松获取运行HPAStainR所需的数据。

作者:Tim O. Nieuwenhuis [aut, cre]

维护者:Tim O. Nieuwenhuis

引文(从R内,输入引用(“HPAStainR”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“HPAStainR”)

超文本标记语言 R脚本 HPAStainR
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpressionGeneSetEnrichment软件
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.1.0),dplyrtidyr
进口 跑龙套,统计数据,尺度stringr宠物猫闪亮的data.table
链接
建议 knitrBiocManagerqpdfhpartestthatrmarkdown
SystemRequirements 4GB内存
增强了
URL
BugReports https://github.com/tnieuwe/HPAstainR
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 HPAStainR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 HPAStainR_1.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) HPAStainR_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) HPAStainR_1.7.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HPAStainR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HPAStainR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/HPAStainR/
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