HDF5Array

doi：10.18129/b9.bioc.hdf5array

HDF5后端用于延迟的对象

生物导体版本：版本（3.15）

Implement the HDF5Array, H5SparseMatrix, H5ADMatrix, and TENxMatrix classes, 4 convenient and memory-efficient array-like containers for representing and manipulating either: (1) a conventional (a.k.a. dense) HDF5 dataset, (2) an HDF5 sparse matrix (stored inCSR/CSC/YALE格式），（3）H5AD文件的中央矩阵（或/层组中的任何矩阵）或（4）10倍基因组稀疏矩阵。所有这些容器均为延迟隔间扩展，因此支持由延迟段对象支持的所有操作（延迟或块加工）。

作者：HervéPagès

维护者：hervépagès

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ HDF5Array”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，覆盖范围，，，，DataImport，，，，datarepresentation，，，，基因数，，，，免疫学，，，，基础设施，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件
版本	1.24.1
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（6年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.4），方法，延迟（> = 0.15.16），RHDF5（> = 2.31.6）
进口	UTIT，统计，工具，矩阵，，，，RHDF5FILTERS，，，，生物基因（> = 0.31.5），S4VECTORS，，，，iranges
链接	S4VECTORS（> = 0.27.13），Rhdf5lib
建议	生物比较，，，，基因组机，，，，总结性特征（> = 1.15.1），H5VCDATA，，，，实验室，，，，tenxbraindata，，，，Zellkonverter，，，，GenomicFeatures，，，，运行，，，，Singlecellexperiment
系统要求	gnu做
增强
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/hdf5array
BugReports	https://github.com/bioconductor/hdf5array/issues
取决于我	carpartmap，，，，Genogam，，，，玛格尔，，，，休息，，，，tenxbraindata，，，，tenxpbmcdata
进口我	饼干，，，，BSSEQ，，，，CEPO，，，，簇发酵，，，，策展，，，，Cytomapper，，，，延迟Tensor，，，，液滴，，，，弗雷泽，，，，GenomicsCores，，，，Glmgampoi，，，，GSVA，，，，HCADATA，，，，imcdatasets，，，，loomexpermiment，，，，mafh5.gnomad.v3.1.1.grch38，，，，mafh5.gnomad.v3.1.2.grch38，，，，Methrix，，，，甲基Seqdata，，，，Minfi，，，，MOFA2，，，，NetSmooth，，，，nxtirfcore，，，，重新甲基化，，，，Scmeth，，，，scry，，，，SignaturesEarch，，，，Singlecellmultimodal，，，，空间Heatmap，，，，Tabulamurissenisdata，，，，变换Gampoi
建议我	beachmat，，，，Biocsklearn，，，，Cellxgenedp，，，，延迟，，，，延迟的matrixstats，，，，我明白，，，，桅杆，，，，mbkmeans，，，，代谢组工厂，，，，Mudata，，，，多亚sayExexperiment，，，，pdatk，，，，qfeatures，，，，Scarray，，，，Scmerge，，，，斯克兰，，，，总结性特征，，，，Zellkonverter
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	hdf5array_1.24.1.tar.gz
Windows二进制	hdf5array_1.24.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	hdf5array_1.24.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hdf5array
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/hdf5array
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/hdf5array/
软件包下载报告	下载统计
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