HDCytoData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HDCytoData

以Bioconductor对象格式收集高维细胞仪基准数据集

Bioconductor版本:发行版(3.16)

包含一组公开可用的高维细胞术基准数据集的数据包，格式化为summarizeexperiment和flowSet Bioconductor对象格式，包括所有必需的元数据。行元数据包括样本id、组id、患者id、参考细胞群或群集标签(如果可用)，以及标识“添加”细胞的标签(如果可用)。列元数据包括通道名称、蛋白质标记名称和蛋白质标记类(细胞类型或细胞状态)。

作者:卢卡斯·m·韦伯[aut, cre]，夏洛特·森森[aut]

维护人员:Lukas M. Weber < lukas.web.edu at gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HDCytoData”)

超文本标记语言	R脚本	1.HDCytoData包
超文本标记语言	R脚本	2.示例和用例
超文本标记语言	R脚本	3.贡献的指导方针
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData，ExperimentHub，ExpressionData，FlowCytometryData，Homo_sapiens_Data，ImmunoOncologyData，SingleCellData
版本	1.18.0
许可证	MIT +文件许可证
取决于	ExperimentHub，SummarizedExperiment，flowCore
进口	跑龙套、方法
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，Rtsne，umap，ggplot2，FlowSOM，mclust
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lmweber/HDCytoData
BugReports	https://github.com/lmweber/HDCytoData/issues
全靠我	cytofWorkflow
进口我
建议我	diffcyt
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	HDCytoData_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HDCytoData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HDCytoData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HDCytoData/
软件包下载报告	下载数据