GenomicDistributionsData

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomicDistributionsData

参考数据的基因组分布包

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这个包提供了准备使用的参考数据的基因组分布包。原始数据从ensembldb中获得，并使用辅助函数进行处理。数据文件可用于以下基因组组装:hg19, hg38, mm9和mm10。

作者:Michal Stolarczyk [aut]， Kristyna Kupkova [aut, cre]， Jose Verdezoto [aut]， John Lawson [ctb]， Jason Smith [ctb]， Nathan C. Sheffield [ctb]

维护者:Kristyna Kupkova

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GenomicDistributionsData”)

超文本标记语言	R脚本	1.我们从基因组分布数据开始
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData，ExperimentHub，基因组
版本	1.6.0
许可证	BSD_2_clause +文件许可证
取决于	R (>= 4.1)
进口	ExperimentHub(> = 1.14.0),AnnotationHub，AnnotationFilter，data.table跑龙套,BSgenome，GenomeInfoDb，GenomicFeatures，GenomicRanges，ensembldb
链接
建议	knitr，BiocStyle，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	http://github.com/databio/GenomicDistributionsData
全靠我
进口我
建议我	GenomicDistributions
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GenomicDistributionsData_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicDistributionsData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GenomicDistributionsData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicDistributionsData/
软件包下载报告	下载数据