Bioconductor版本:发行版(3.16)
这个包给出了基因表达签名的实现及其与每个签名的距离。基因表达签名表示为其表达与感兴趣的生物状态相关的基因列表。使用基于Kolmogorov-Smirnov统计量的非参数、基于秩的模式匹配策略来定义它的距离。基因表达特征及其距离可用于检测药物、疾病和感兴趣的生物状态特征之间的相似性。
作者:曹阳[aut, cre],李飞[ctb],鹿晗[ctb]
维护者:杨操< yiluheiheheat gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“GeneExpressionSignature”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager")::install("GeneExpressionSignature")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GeneExpressionSignature”)
超文本标记语言 | R脚本 | GeneExpressionSignature |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,软件 |
版本 | 1.44.0 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(11年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 4.0) |
进口 | Biobase、统计数据、方法 |
链接 | |
建议 | apcluster,GEOquery,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/yiluheihei/GeneExpressionSignature |
BugReports | https://github.com/yiluheihei/GeneExpressionSignature/issues/ |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GeneExpressionSignature_1.44.0.tar.gz |
Windows二进制 | GeneExpressionSignature_1.44.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | GeneExpressionSignature_1.44.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | GeneExpressionSignature_1.44.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneExpressionSignature |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GeneExpressionSignature |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/GeneExpressionSignature/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GeneExpressionSignature/ |
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