GOstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOstats

去微阵列的操作工具

Bioconductor版本:版本(3.15)

相互作用的一组工具和微阵列数据。各种基本操作工具图,假设检验和其他简单的计算。

作者:罗伯特先生(aut),赛斯猎鹰(施),罗伯特·Castelo[所有],Bioconductor包维护者(cre)

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

从内部引用(R,回车引用(“GOstats”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GOstats”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GOstats”)

PDF R脚本 超几何测试不太常见的生物模型
PDF R脚本 使用GOstats超几何测试
PDF R脚本 使用GOstats可视化数据
PDF 参考手册

细节

biocViews 注释,,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,微阵列,MultipleComparison,通路,软件
版本 2.62.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.10),Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.43.2),
进口 方法、统计stats4,AnnotationDbi(> = 0.0.89),GO.db(> = 1.13.0),RBGL,注释(> = 1.13.2),AnnotationForge,Rgraphviz
链接
建议 hgu95av2.db(> = 1.13.0),所有,,genefilter,RColorBrewer,xtable,SparseM,GSEABase,geneplotter,org.Hs.eg.db,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 MineICA,PloGO2
进口我 affycoretools,吸引,categoryCompare,GmicR,理想的,MIGSA,miRLAB,netZooR,pcaExplorer,ReportingTools,scTensor
建议我 a4,类别,fastLiquidAssociation,fgga,GSEAlm,interactiveDisplay,MineICA,中长期规划,qpgraph,RnBeads,安全
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 GOstats_2.62.0.tar.gz
Windows二进制 GOstats_2.62.0.zip
macOS 10.13(高山脉) GOstats_2.62.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOstats
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GOstats
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GOstats/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
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