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FGNet
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DOI:10.18129 / B9.bioc.FGNet
功能基因网络来源于生物富集分析
Bioconductor版本:发行版(3.16)
在多个注释空间中，从富集分析的聚类中构建并可视化功能基因和术语网络。该软件包包括一个图形用户界面(GUI)和通过DAVID、GeneTerm Linker、gage (GSEA)和topGO执行功能丰富分析的功能。
作者:Sara Aibar, Celia Fontanillo, Conrad Droste和Javier De Las Rivas。
维护者:Sara Aibar
引文(从R内，输入引用(“FGNet”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“FGNet”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | FGNet |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释，聚类，FunctionalGenomics，去，GeneSetEnrichment，网络，NetworkEnrichment，通路，软件，可视化 |
| 版本 | 3.32.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(9.5年) |
| 许可证 | GPL (>= 2) |
| 取决于 | R (>= 4.2.0) |
| 进口 | igraph(> = 0.6),hwriter，R.utils，XML，plotrix，reshape2，RColorBrewer，png，方法，统计，utils，图形，grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | RCurl，计，topGO，GO.db，reactome.db，RUnit，BiocGenerics，org.Sc.sgd.db，knitr，rmarkdown，AnnotationDbi，BiocManager |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.cicancer.org |
| 全靠我 | |
| 进口我 | IntramiRExploreR |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | FGNet_3.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | FGNet_3.32.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | FGNet_3.32.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | FGNet_3.32.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FGNet |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FGNet |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/FGNet/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/FGNet/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
