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小伙子
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DOI:10.18129 / B9.bioc.FELLA
代谢组学数据的解释和浓缩
Bioconductor版本:版本(3.17)
使用KEGG浓缩的代谢组学数据条目。给定一组影响化合物的,小伙子建议影响反应,酶,模块和通路使用标签在知识传播网络模型。结果呈现子网可以出口。
作者:塞吉奥Picart-Armada (aut (cre),弗朗西斯Fernandez-Albert (aut),亚历山大Perera-Lluna (aut)
维修工:塞尔吉奥Picart-Armada <塞尔吉。在upc.edu picart >
从内部引用(R,回车引用(“小伙子”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“小伙子”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“小伙子”)
| R脚本 | 例如:脂肪肝研究亩所支配 | |
| R脚本 | 例如:氧苯酮博览会gilt-head鲷 | |
| R脚本 | 小伙子 | |
| HTML | R脚本 | 快速启动 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 去,GraphAndNetwork,KEGG,代谢组学,网络,NetworkEnrichment,通路,软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.5.0) |
| 进口 | 方法、igraph矩阵,KEGGRESTplyr,统计数据、图形、跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | 闪亮的,DT, magrittr visNetwork knitr,BiocStylermarkdown testthat,biomaRt,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,AnnotationDbi,GOSemSim |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | FELLA_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | FELLA_1.20.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | FELLA_1.20.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | FELLA_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FELLA |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/小伙子 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/FELLA/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/FELLA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
