Bioconductor版本:版本(3.16)
给定一个示例数据表和设计公式,ExploreModelMatrix为探索生成交互式应用程序生成的设计矩阵。这可以有助于解释模型系数和构造适当的对比(广义)线性模型。也可以生成静态可视化。
作者:夏洛特Soneson (aut (cre),费德里科•马里尼(aut)迈克尔·爱(aut),Florian现(aut)迈克尔·施(aut)
维护人员:夏洛特Soneson < charlottesoneson gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“ExploreModelMatrix”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ExploreModelMatrix”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ExploreModelMatrix”)
HTML | R脚本 | ExploreModelMatrix |
HTML | R脚本 | ExploreModelMatrix-deploy |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DifferentialExpression,ExperimentalDesign,回归,软件 |
版本 | 1.10.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | |
进口 | 闪亮的(> = 1.5.0),shinydashboard,DT,cowplot跑龙套,dplyr,magrittr,tidyr,ggplot2、统计数据、方法rintrojs,尺度,宠物猫,质量,limma,S4Vectors,shinyjs |
链接 | |
建议 | testthat(> =魅惑,knitr,rmarkdown,htmltools,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/csoneson/ExploreModelMatrix |
BugReports | https://github.com/csoneson/ExploreModelMatrix/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | ExploreModelMatrix_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | ExploreModelMatrix_1.10.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | ExploreModelMatrix_1.10.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | ExploreModelMatrix_1.10.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExploreModelMatrix |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ExploreModelMatrix |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/ExploreModelMatrix/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ExploreModelMatrix/ |
包下载报告 | 下载数据 |