ExperimentSubset

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExperimentSubset

使用Bioconductor实验对象管理数据子集

Bioconductor版本:发行版(3.16)

实验对象(如summarizeexperiment或singlecel实验)是一个或多个类似矩阵的测试以及相关的行和列数据的数据容器。下游分析通常只需要原始数据的一个子集。例如，过滤出质量差的样品需要在分析之前排除一些列。experiment子集对象是一个容器，用于有效地管理相同数据的不同子集，而不必为每个新子集创建单独的对象。

作者:Irzam Sarfraz [aut, cre]，穆罕默德·阿西夫[aut, ths]——约书亚·d·坎贝尔[au]

维护者:Irzam Sarfraz

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ExperimentSubset”)

超文本标记语言	R脚本	experiment子集类的介绍
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，基础设施，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.0.0)，SummarizedExperiment，SingleCellExperiment，SpatialExperiment，TreeSummarizedExperiment
进口	方法,矩阵，S4Vectors
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，covr统计数据,食物，嘘，scds，TENxPBMCData，气道
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ExperimentSubset_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	ExperimentSubset_1.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ExperimentSubset_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ExperimentSubset_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExperimentSubset
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ experiment子集
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ExperimentSubset/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ExperimentSubset/
软件包下载报告	下载数据