ExperimentHub

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExperimentHub

客户端访问ExperimentHub资源

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这个包为Bioconductor ExperimentHub网络资源提供了一个客户端。ExperimentHub提供了一个中心位置，可以访问来自实验、出版物或培训课程的策划数据。每个资源都有关联的元数据、标签和修改日期。客户端创建并管理检索到的文件的本地缓存，支持快速和可重复的访问。

作者:Bioconductor Package Maintainer [cre]， Martin Morgan [aut]， Marc Carlson [ctb]， Dan Tenenbaum [ctb]， Sonali Arora [ctb]， Valerie Oberchain [ctb]， Kayla Morrell [ctb]， Lori Shepherd [aut]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内，输入引用(“ExperimentHub”))：

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ExperimentHub”)

超文本标记语言	R脚本	ExperimentHub:访问ExperimentHub Web服务
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，GUI，基础设施，软件，ThirdPartyClient
版本	2.6.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,BiocGenerics(> = 0.15.10),AnnotationHub(> = 3.3.6),BiocFileCache(> = 1.5.1)
进口	跑龙套,S4Vectors，BiocManager，旋度，rappdirs
链接
建议	knitr，BiocStyle，rmarkdown，HubPub
SystemRequirements
增强了	ExperimentHubData
URL
BugReports	https://github.com/Bioconductor/ExperimentHub/issues
全靠我	adductomicsR，alpineData，BeadSorted.Saliva.EPIC，benchmarkfdrData2019，biscuiteerData，bodymapRat，CellMapperData，clustifyrdatahub，crisprScoreData，curatedAdipoChIP，DMRcatedata，EpiMix.data，ewceData，FlowSorted.Blood.EPIC，FlowSorted.CordBloodCombined.450k，HDCytoData，HiContactsData，HighlyReplicatedRNASeq，HumanAffyData，iSEEhub，LRcell，mcsurvdata，MetaGxBreast，MetaGxOvarian，MetaGxPancreas，muscData，NanoporeRNASeq，NestLink，nullrangesData，ObMiTi，octad，octad.db，restfulSEData，RNAmodR。数据，SCATEData，scpdata，SeqSQC，sesameData，SimBenchData，spatialDmelxsim，STexampleData，鞑靼，TENxVisiumData，VectraPolarisData，WeberDivechaLCdata
进口我	adductData，BioImageDbs，BloodGen3Module，celldex，chipseqDBData，CLLmethylation，coMethDMR，CopyNeutralIMA，curatedMetagenomicData，curatedTBData，curatedTCGAData，depmap，DMRcate，DropletTestFiles，DuoClustering2018，easierData，emtdata，ENmix，EpiMix，epimutacions，ExperimentHubData，FieldEffectCrc，GenomicDistributionsData，GSEABenchmarkeR，HarmonizedTCGAData，HCAData，HMP16SData，HMP2Data，imcdatasets，LRcellTypeMarkers，m6Aboost，MACSr，MerfishData，MethReg，methylclock，methylclockData，MethylSeqData，microbiomeDataSets，MouseGastrulationData，MouseThymusAgeing，msigdb，NxtIRFdata，PhyloProfile，PhyloProfileData，preciseTADhub，pwrEWAS.data，restfulSE，RLHub，scRNAseq，SFEData，signatureSearch，signatureSearchData，SingleCellMultiModal，singleCellTK，SingleMoleculeFootprintingData，spatialLIBD，TabulaMurisData，TabulaMurisSenisData，TENxBrainData，TENxBUSData，TENxPBMCData，肺结核，xcoredata
建议我	曾帮工，AnnotationHub，bambu，BioPlex，BioPlex，celaref，celarefData，CellMapper，curatedAdipoArray，DEqMS，埃尔默，epimutacionsData，genomicInstability，GSE103322，GSE13015，GSE159526，GSE62944，HDF5Array，metavizr，missMethyl，MsBackendRawFileReader，马斯喀特，nullranges，quantiseqr，rawrr，recountmethylation，SingleMoleculeFootprinting，关注的焦点，standR，TCGAbiolinks，TENxIO，tissueTreg，“航行者”号，xcore
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址在R会话中使用此包的说明。

源包	ExperimentHub_2.6.0.tar.gz
Windows二进制	ExperimentHub_2.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ExperimentHub_2.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ExperimentHub_2.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExperimentHub
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ExperimentHub
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ExperimentHub/
软件包下载报告	下载数据