沙丘
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DOI:10.18129 / B9.bioc.Dune
提高单细胞RNA-Seq细胞类型发现的可复制性
Bioconductor版本:发行版(3.16)
给定一组聚类标签，Dune合并成对的聚类，以增加标签之间的平均ARI，提高可复制性。
作者:Hector Roux de Bezieux [aut, cre]
，凯利街[aut]
维护者:Hector Roux de Bezieux < Hector。Rouxdebezieux在berkeley.edu>
引文(从R内，输入引用(“沙丘”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“沙丘”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 沙丘装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 聚类，GeneExpression，RNASeq，SingleCell，软件，转录组，可视化 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.11 (R-4.0)(2.5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.6) |
| 进口 | BiocParallel，SummarizedExperiment跑龙套,ggplot2，dplyr，tidyr，RColorBrewer，magrittr，gganimate，purrr，aricode |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，rmarkdown，testthat(> = 2.1.0的) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | Dune_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Dune_1.10.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | Dune_1.10.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | Dune_1.10.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Dune |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Dune |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/Dune/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Dune/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
