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DominoEffect
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DOI:10.18129 / B9.bioc.DominoEffect
识别和注释的蛋白质热点残基
Bioconductor版本:版本(3.17)
功能支持热点残基在蛋白质的识别和注释。这些个别氨基酸积累突变以更高的速度比周围地区。
作者:Marija Buljan和彼得Blattmann
维护人员:Marija Buljan < marija.buljan。2:gmail.com >,彼得Blattmann < Blattmann在imsb.biol.ethz.ch >
从内部引用(R,回车引用(“DominoEffect”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DominoEffect”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“DominoEffect”)
| HTML | R脚本 | 装饰图案为DominoEffect包 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 对齐,蛋白质组学,SequenceMatching,软件,SomaticMutation |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(5年) |
| 许可证 | GPL (> = 3) |
| 取决于 | R (> = 3.5) |
| 进口 | biomaRt、数据。表,跑龙套,统计数据,Biostrings,SummarizedExperiment,VariantAnnotation,AnnotationDbi,GenomeInfoDb,IRanges,GenomicRanges、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr、testthat rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | DominoEffect_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | DominoEffect_1.20.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | DominoEffect_1.20.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | DominoEffect_1.19.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DominoEffect |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DominoEffect |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/DominoEffect/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DominoEffect/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
